Роль вакуумной системы состоит в том, чтобы выводить неконденсируемые газы и воздух из холодной ловушки, чтобы создать вакуум, который поддерживает скорость сублимации продукта. Высокий вакуум эффективно снижает сопротивление потоку водяного пара, избегая окисления в процессе сушки из - за отсутствия воздуха.

Когда вакуумное замораживание высыхает, давление в холодной ловушке не тем ниже, чем лучше, но должно контролироваться в определенном диапазоне. Низкое давление, безусловно, способствует сублимации льда в продукте. Однако, поскольку давление слишком низкое для теплопередачи неблагоприятно, продукт нелегко получить тепло, скорость сублимации вместо этого снижается.

Когда давление слишком высокое, скорость сублимации льда в продукте замедляется, поэтому температура самого продукта увеличивается, когда выше определенной степени, продукт будет расплавлен, что приводит к провалу замораживания и высыхания.