Микробиологические лаборатории обычно включают в себя три зоны: чистую зону, операционную зону и стерильную зону, которые можно разделить на подготовительную комнату, культурную комнату, семенную комнату, дезинфекционную комнату, стерильную комнату и многие другие комнаты. Микробиологические лаборатории различаются в зависимости от области специализации (охрана окружающей среды, продукты питания, лекарства, медицина и т. Д.) и характера (преподавание, производство, научные исследования, тестирование и т. Д.), состав и размер лаборатории сильно различаются.