Секвенатор третьего поколения

ДоговариваемыйОбновление на05/07

Модель

Природа производителя: Производители

Категория продукта

Место происхождения

Онлайн Консультация

Обзор

Секвенатор третьего поколения с наноотверстием GridION - это экономичная и компактная настольная система, обеспечивающая секвенирование по требованию и интегрированную обработку данных в реальном времени. Способность GridION Mk1 работать с пятью потоковыми блоками одновременно или в одиночку с общей производительностью до 150 Гб обеспечивает экономически выгодный доступ к преимуществам секвенирования наноотверстий в режиме реального времени с длинным чтением и длинным чтением для занятых лабораторий и поставщиков услуг. Интегрированная высокопроизводительная обработка данных снижает потребность в сложной ИТ - инфраструктуре.

Подробности о продукте

I. ОБЗОР ПРОДУКТА

Оксфордские нанопористые технологии ® 的Секвенатор третьего поколения™ Мк1Это компактная настольная система секвенирования. Это позволяет проводить до пяти экспериментов секвенирования одновременно или отдельно. Вы можете выбрать, сколько ресурсов вы используете за один раз. GridION Mk1 также позволяет секвенировать наноотверстия в качестве услуги.

GridION Mk1 имеет пять секвенированных портов, которые могут подключаться к потоковому блоку Minion / GridION или адаптеру Flongle с потоковым блоком, а также высокопроизводительный интегрированный компьютер и ускоритель тона. Устройство может вызывать данные, генерируемые пятью потоковыми блоками / Flongle в режиме реального времени. Текущая химия и программное обеспечение поддерживают генерацию до 150 Гбайт данных во время работы GridION Mk1.

Инфраструктура, необходимая для создания GridION Mk1, крайне мала и не требует модернизации. Новое устройство требует только питания и сетевого подключения через порт Ethernet.Внешние устройства (например, клавиатура и мышь) предлагают три интерфейса USB 3.0. Монитор должен быть подключен через IsplayPort. Устройство питается от городского электричества через линию C13, а при включении - через кнопку питания передней панели.

纳米孔三代测序仪GridION

II. Основные технологии

Секвенирование Oxford Nanopore основано на технологии одномолекулярного обнаружения наноотверстий. При секвенировании молекулы нуклеиновой кислоты (DNA / RNA) проходят через наноотверстия по одному оснований в виде одной цепи под действием моторазы. При прохождении оснований сила тока в наноотверстиях изменяется, и сигналы тока, соответствующие различным оснований (A, T, C, G) и модифицированным основаниям, различаются. Устройство захватывает эти изменения тока в режиме реального времени через Minknow ™ Такое программное обеспечение преобразуется в последовательность оснований для достижения прямого секвенирования одной молекулы. Технология не требует расширения PCR, может сохранять информацию о модификации основания, а длина чтения не ограничена, может обеспечить анализ данных в реальном времени, как портативность, так и эффективность.

纳米孔三代测序仪GridION

III. Преимущества работы оборудования

1. ГибкостьА.Секвенатор третьего поколения™ Мк1Возможность одновременной работы до 5 отдельных устройств Minion Flow Cell, поддерживающих параллельное секвенирование отдельных образцов или многоканальное наложение отдельных образцов, гибко адаптируется к требованиям многовыборочной обработки или повышения глубины данных, что значительно повышает эффективность экспериментов.

2. Доступ к данным в режиме реального времени:: Может мгновенно генерировать данные секвенирования, не дожидаясь завершения полного процесса секвенирования, чтобы помочь быстро получить доступ к наземным аналитическим данным, особенно для сценариев с высоким сроком давности, таких как аварийное обнаружение.

3. Интегрированные вычислительные мощности:: Встроенный * вычислительный модуль, позволяющий непосредственно проводить анализ данных в режиме реального времени, не полагаясь на сложную внешнюю ИТ - инфраструктуру, снижает порог развертывания устройства и упрощает экспериментальный рабочий процесс.

4.Компактный малый дизайн:: Оборудование занимает небольшую площадь, использует настольную компоновку, экономит лабораторное пространство, приспосабливается ко всем видам лабораторной среды, нет необходимости отдельно планировать большую площадь для размещения оборудования.
5. Неограниченная продолжительность чтения:: Может секвенировать молекулы нуклеиновой кислоты любой длины от коротких до сверхдлинных фрагментов, не ограничиваясь длиной фрагмента, может эффективно анализировать сложные структурные вариации генома и другие проблемы, преодолевая традиционные ограничения секвенирования с коротким чтением.

IV. Применимое применение

1. Бактериологическая макрогеномика:: 5 независимых центров Flow Cell могут обрабатывать образцы параллельно, в сочетании с ультрадлинным чтением, точным анализом структуры флоры и функциональных генов, 48 ГБ / канальных данных для сложных исследований разнообразия флоры.

2. Разделенные штаммы бактерий:: Одноканальный выход высоких данных обеспечивает высокое покрытие генома выделенного штамма, быстро завершает сборку и аннотацию, помогает анализировать ключевую информацию, такую как гены устойчивости к лекарствам и токсикологические факторы.

3. Бактериальный полный геном:: Нет необходимости в расширении PCR, чтобы уменьшить предпочтения секвенирования, сверхдлинное чтение эффективно решает проблему повторяющихся последовательностей генома, предоставляя высококачественные данные для отслеживания эволюции бактерий и молекулярной дифференциации.

4. Вирусный ампликатор:: Экспорт данных в режиме реального времени быстро идентифицирует вирусную изменчивость, многоканальное параллельное обнаружение нескольких вирусных ампликаторов одновременно, повышает эффективность мониторинга вирусной изменчивости и эпидемиологических исследований.

Общая длина 16S rRNA:: Покрыть полноразмерную последовательность 16S rRNA, чтобы избежать проблемы расплывчатости классификации с коротким чтением, многоканальная поддержка большого количества образцов параллельно, для достижения точной идентификации уровня штамма.

6. Полная экзотическая подгруппа:: Высокий объем данных для удовлетворения потребностей в глубоком секвенировании внешних подсекторов, сверхдлинное чтение и точное обнаружение отсутствия вставки и других сложных вариаций, предоставление ключевых данных для генетических заболеваний, исследований, связанных с опухолями.

7. Полная транскрипционная группа (cDNA):: Полная последовательность cDNA может быть получена без сращивания, чтобы четко различать подтипы переменного сдвига, многоканальное параллельное повышение эффективности обнаружения транскриптов с низким содержанием.

8. Меньшая транскрипционная группа (прямая РНК):: Прямое секвенирование РНК сохраняет информацию о модификации основания, сверхдлинное чтение получает полную транскрипционную последовательность, адаптируется к вирусам, низкоуровневым биологическим группам малых транскрипций исследований, быстро анализирует динамику транскрипции.

V. Адаптивные реагенты и программное обеспечение

Совместимость с Flow Cell:: Поддержка всех Flow Cell серии Minion (например, R9.4.1, R10.4), включая специализированные модели для ДНК, РНК и модификационного тестирования;

纳米孔三代测序仪GridION

Экология программного обеспечения: Использование Minknow ™ (Сбор данных), Guppy (распознавание оснований), Minimap2 (сравнение последовательностей), совместимые со сторонними аналитическими инструментами (такими как Nanoplot, Flye).

Зебра рыба (Beijing) Technology Co., Ltd. предоставляет вам параметры прибора, цены, выбор, технические принципы и другую информацию, чтобы узнать больше информации, добро пожаловать связаться с нами.

Похожий продукт рекомендовать