Системные требования PromethION 2 Integrated

I. ОБЗОР ПРОДУКТА

Системные требования PromethION 2 Integrated(P2i) Небольшое настольное устройство, предназначенное для работы до двух блоков скорости потока PromethION. Каждый мобильный блок является независимым и адресуемым, что означает, что эксперименты могут проводиться одновременно или в одиночку. P2i - это автономный продукт, который включает в себя вычисления корпоративного уровня и отвечает за сбор всех данных и вызов базового адреса на устройстве. Он также позволяет пользователям предоставлять услуги секвенирования наноотверстий.

Системные требования PromethION 2 IntegratedСодержит два порта секвенирования, которые могут быть вставлены в блок потока. Устройство имеет те же функции, что и меньший Promethion 2 Solo, но с добавлением * вычислительной функции и встроенным графическим процессором NVIDIA Ampere, способным вызывать вызовы базы данных из двух потоковых блоков Promethion в режиме реального времени. Текущая химия и программное обеспечение поддерживают генерацию до 290 Гбайт * данных из одного мобильного блока PromethION (* теоретический вывод Max основан на секвенировании 420 оснований в секунду в течение 72 часов).

II. Основные технологии

Секвенирование Oxford Nanopore основано на технологии одномолекулярного обнаружения наноотверстий. При секвенировании молекулы нуклеиновой кислоты (DNA / RNA) проходят через наноотверстия по одному оснований в виде одной цепи под действием моторазы. При прохождении оснований сила тока в наноотверстиях изменяется, и сигналы тока, соответствующие различным оснований (A, T, C, G) и модифицированным основаниям, различаются. Устройство захватывает эти изменения тока в режиме реального времени через Minknow ™ Такое программное обеспечение преобразуется в последовательность оснований для достижения прямого секвенирования одной молекулы. Технология не требует расширения PCR, может сохранять информацию о модификации основания, а длина чтения не ограничена, может обеспечить анализ данных в реальном времени, как портативность, так и эффективность.

III. Основные преимущества производительности

Интегрированный дизайн рабочего стола с высокой степенью интеграции:Использование полностью автономной формы настольного устройства, встроенного полного вычислительного модуля, без дополнительных внешних компьютеров или серверов, значительно упрощает процесс развертывания оборудования, экономит лабораторное пространство, адаптируется к различным научным и клиническим сценариям.

Сильная вычислительная сила + интуитивное управление, выдающаяся эффективность:Установка высокопроизводительного GPU для идентификации оснований в реальном времени, сборки генома и других сложных аналитических задач для обеспечения достаточной вычислительной поддержки; Оснащенный встроенным экраном, вы можете напрямую видеть прогресс секвенирования, сигналы тока и другую ключевую информацию, более удобное взаимодействие.

Двойной Flow Cell параллельный, гибкий для:Поддержка одновременной работы до 2 PromethION Flow Cell позволяет выбрать одноканальное независимое секвенирование или двухканальный синхронный запуск в соответствии с экспериментальными потребностями, как для быстрого обнаружения небольших партий образцов, так и для решения задач секвенирования среднего и высокого потока и более гибкого использования ресурсов.

Предварительная конфигурация интерполяции, порог очень низкий:Завод оборудования завершил предварительную конфигурацию системы, без ввода в эксплуатацию сложных параметров, включение питания может запустить процесс секвенирования, даже непрофессиональный технический персонал может быстро начать работу, значительно снижая затраты на эксплуатацию и обслуживание.

Высокопроизводительное хранение и поддержка вычислительной мощности:Установка SSD сверхбольшой емкости 16 ТБ для локального хранения массивных секвенированных данных без зависимости от внешних устройств хранения; ОЗУ с высокой пропускной способностью 64 ГБ обеспечивает бесперебойную работу процессов чтения, записи и анализа данных и в сочетании с GPU * NVIDIA A - Series обеспечивает мощную вычислительную мощность для сложной идентификации оснований в реальном времени, сборки генома и анализа вариаций, что значительно сокращает время анализа данных.

Взаимодействие и гибкость:Установка сенсорного экрана с высоким разрешением, может четко отображать прогресс секвенирования, сигналы тока, результаты анализа данных и другую ключевую информацию, взаимодействие операций более интуитивно и точно; В то же время поддержка стыковки существующей компьютерной инфраструктуры, как через локальный сенсорный экран, так и в оригинальную систему лаборатории, гибкая адаптация к различным привычкам использования и рабочим процессам.

IV. Области применения

Всегеномные исследования:: Одноканальные данные 8Тб позволяют осуществлять глубокое секвенирование всего генома человека на глубине 30× и более, а также сборку полного генома с помощью Длинного чтения T2T (от теломер до теломеров) для анализа сложных структурных вариаций;

Макрогеномный глубокий анализ:: Высокая урожайность глубокого секвенирования макрогенома, поддерживающего сложные образцы окружающей среды, такие как почва и океан, может обнаруживать микроорганизмы с низкой плотностью (< 0,1%) и точно аннотировать функциональные гены;

Клиническое массовое тестирование:: Двухканальная параллельная обработка сотен клинических образцов (например, полное секвенирование генома вируса) одновременно, анализ данных в реальном времени помогает быстро дифференцировать и отслеживать вариации для поддержки экстренного реагирования общественного здравоохранения;

Исследования в области селекции растений и животных:: Предоставление высокопроизводительных данных с длинным чтением для больших геномов животных и растений (например, геномов пшеницы и крупного рогатого скота), которые помогают в разработке молекулярных маркеров и построении генетических карт.

V. Технические характеристики оборудования

:: Функциональный диапазон электронных устройств от + 5ºC до + 40ºC

Зебра рыба (Beijing) Technology Co., Ltd. предоставляет вам параметры прибора, цены, выбор, технические принципы и другую информацию, чтобы узнать больше информации, добро пожаловать связаться с нами.