секвенирование второго поколения

секвенирование второго поколенияВведение:

Эпигенетика (epigenetics) является одной из горячих точек в текущих исследованиях молекулярной биологии, а метилирование ДНК является важной частью эпигенетики и одной из основных форм эпигенетической модификации геномной ДНК. Метилирование ДНК - это модификация, при которой метильные группы переносятся на основание цитозина под катализатором метилметалазы ДНК (DNMTS). Это происходит в основном в районах, богатых бинуклеотидными островами CpG. Обычно острова CpG существуют в недерметилированной форме (активной форме), и метилирование ДНК может привести к замалчиванию экспрессии генов. Аномальная активность DNMTS тесно связана с болезнью. Он играет жизненно важную роль в поддержании нормальной клеточной функции, передаче генетического отпечатка генома, развитии эмбрионов и возникновении опухолей у людей.

Морские крылья и живые организмы обрабатываются гидросульфатом (bisulfite), с помощью мульти - PCR для расширения фрагментов цели, добавления баркода и секвенирования универсальных соединений в Illumina X10секвенирование второго поколенияПлатформа секвенирует продукты PCR с высоким потоком и использует методы биоинформатики для точного количественного расчета состояния метилирования в местах метилирования в целевом диапазоне, что значительно снижает затраты на исследования при завершении тестирования целевой области.

Hi - MethylSeq сочетает в себе технологию преобразования сульфитов и высокопроизводительного секвенирования целевых усилителей для достижения точного количественного анализа метилирования в нескольких сегментах и точках. Этот метод применим к исследованиям метилирования в интересующих целевых сегментах, чтобы дополнительно подтвердить положительные участки, отобранные для исследований метилирования всего генома в больших образцах.

Обработка тяжелыми сульфатами - это золотой стандарт обработки геномной ДНК в метилировании ДНК, химический процесс, который может привести к повреждению ДНК, что затрудняет достижение 100% эффективности преобразования и сохранение целостности ДНК одновременно, оба из которых требуют определенного баланса. За пределами целевой области Hi - MethylSeq для точной оценки коэффициента конверсии выборки в качестве внутреннего сравнения были выбраны три последовательности, не относящиеся к острову CpG.