Можно ли использовать масс - спектрометрию для секвенирования белков?

Можно ли использовать масс - спектрометрию для секвенирования белков?Технические услуги тестирования Подробнее

I. Справочная информация

Секвенирование dànbáizhí позволяет непосредственно выявить последовательность аминокислот dánbáizhí, которая является основой для понимания структуры и функций dánbáizhí. После секвенирования белка можно дополнительно предсказать трехмерную структуру dànbáizhí, а затем проанализировать его биологические функции и механизмы взаимодействия. Это важно для раскрытия тайн жизнедеятельности, понимания возникновения и развития болезней. Современные технологии секвенирования белков включают в себя: масс - спектрометрию с нуля, разложение Эйдмана и секвенирование наноотверстий. В настоящее время более широко используется секвенирование с нуля dànbáizhí на основе масс - спектрометрии. Секвенирование с нуля (de novo protein sequencing) - это новый метод секвенирования, который напрямую измеряет последовательность аминокислот dànbaizhí, не полагаясь ни на какую известную последовательность или информацию из базы данных dànbaizhí. Антитела, как молекулы bíbú kêsh vio в нашей иммунной системе, являются ценным инструментом в области медицинской диагностики и лечения, а dànbaizhí секвенируется с нуля и имеет важное применение в области антител.

II. Технические процессы

Секвенирование dánbáizhí на основе масс - спектрометрии представляет собой получение качественной информации о последовательности аминокислот пептидного сегмента, т.е. вторичной спектроскопии, с использованием масс - спектрометра, и анализ последовательности пептидного сегмента непосредственно из масс - спектрометрии второго уровня с помощью алгоритма секвенирования с нуля, который затем соединяется, чтобы получить полную последовательность аминокислот dánbáizhí. Технологический процесс секвенирования dànbáizhí: подготовка проб → dánbáizhí → разделение пептидных сегментов → масс - спектрометрия → анализ данных. При секвенировании dànbáizhí необходимо обратить внимание на следующие вопросы: Выберите подходящий фермент для решения фермента dànbáizhí; Обеспечить стабильную производительность масс - спектрометра и повысить точность данных.

III. Перечень исследований

Моноклональная глиобластоз (MGUS) - это плазматическое заболевание, которое характеризуется наличием основного моноклонального антитела (M - белка) в сыворотке крови. Авторы использовали комбинированный анализ жидкой хроматографии - масс - спектрометрии для обнаружения M - белка типа IgG1 в сыворотке крови человека. Используя различные протеазы для ферментации М - белка, используя метод секвенирования с нуля, чтобы получить антипептидный сегмент, после сращивания пептидных сегментов Zui в конечном итоге определил всю тяжелую и легкую цепную последовательность М - белка. Кроме того, авторы описали уровни гликирования в области CDR антител.

Секвенирование масс - спектрометрии dànbaizhí помогает обнаружить новые лекарственные мишени, предоставляя важную информацию для проектирования и скрининга лекарств. Используя методы секвенирования, ученые могут идентифицировать dànbáizhí, связанные с болезнью, и затем разработать лекарства для этих dánbáizhí, чтобы достичь лечения jíngzhán. Используя технологию секвенирования dánbáizhí, врачи могут более jíngquè оценивать состояние пациента, прогнозировать тенденции развития заболевания и, таким образом, разрабатывать более персонализированные варианты лечения. Это не только повышает эффективность лечения, но и уменьшает побочные эффекты и улучшает качество жизни пациентов.

Основываясь на литературе, опубликованной в Nature Biotechnology и журнале протеомики JPR, Beijing Baitaipaik Biotechnology Co., Ltd. разработала программное обеспечение для анализа последовательности антител в сочетании с существующими фоновыми знаниями zhuanyè, имеет самоисследуемый метод расчета исходных данных масс - спектра, использует принцип широкого и узкого доступа и обеспечивает точную идентификацию последовательности антител / белков без потери какой - либо достоверной информации. В процессе секвенирования используются масс - спектрометры Orbitrap Eclipse и Orbitrap Fusion Lumos с высоким разрешением и чувствительностью для обеспечения качества данных и точности результатов. Период проекта секвенирования белков / антител составляет от 3 до 4 недель.

IV. Ссылки на литературу

Альбертж, Денбоер, Аржанд и др. Прямое обнаружение на основе массовой спектрометрии и секвенирование антител моноклональной гаммопатии неопределенного значения из сыворотки пациента: исследование случая. Журнал исследований протеома, 2023, 22(9):3022-3028.

Bandeira N, Pham V, Pevzner P, et al. Автоматическое секвенирование белков de novo моноклональных антител [J]. Природа Биотехнология, 2008, 26(12):1336-1338

Биотехнологический проект BatterPack

I. Секвенирование белков

BatterPaik Biotechnology использует новый масс - спектрометр Obitrap Fusion Lumos компании Thermo и систему секвенирования разложения Edman компании Isman для анализа последовательности dànbaizhí, предоставляя услуги по секвенированию белков на основе масс - спектрометрии, включая анализ состава аминокислот dànbaizhí, анализ Nduáncè xú, Cduáncè xú и полных последовательностей, а также анализ последовательностей n - enbáizhí на основе разложения Эдмана. Для dánbáizhí неизвестных теоретических последовательностей предлагается секвенирование dánbáizhí с нуля на основе метода нулевого секвенирования для анализа белковых последовательностей.

Преимущества сервиса:

Использование современного в мире масс - спектрометрического прибора Obitrap Fusion Lumos.

Обеспечивает 100 - процентное покрытие измеренной последовательности белков - мишеней;

Можно определить до 70 аминокислотных последовательностей на N - конце белка;

4. Могут быть измерены образцы в различных формах: белковые растворы, полосы белка PVDF;

5.Низкий объем использования образца: образец белка требует всего 5 - 10 мкг, чтобы завершить тестирование;

Секвенирование не зависит от модификаций n - конца, таких как закрытие n - конца, ПЭК и гликолизация.

II. ГЛОГИЧЕСКАЯ СИСТЕМА ДАНБАЙШИ

BatterPaik Biotech использует платформу Orbitrap Fusion Lumos от Thermo Fisher в сочетании с Nano - LC для предоставления количественной d à nbáizhí, целевой d à nbáizhí, полипептидной гистологии, транскрипционной модифицированной белковой гистологии и других услуг по групповому анализу d à nbáizhí. Кроме того, BatterPack Biotechnology запустила новую услугу 4Ddànbáizhí на основе timsTOF Pro, которая помогает в исследованиях, таких как протеомика микрообразцов, медицина больших групп образцов и высокопроизводительная модификация.

Преимущества сервиса:

1. Высокопроизводительный количественный анализ белков: крупномасштабный экспериментальный анализ в многоконтрольной группе, в ходе которого были обнаружены новые биомаркеры;

2. Многочисленные методы маркировки d ànbáizhí in vitro и вне организма, применяемые для анализа различных образцов тканей, клеток, крови и т.д.

Высокая чувствительность масс - спектрометрического анализа и высокая повторяемость результатов экспериментов;

4. Может обнаруживать белки с низким содержанием, с широким линейным диапазоном;

5.zhuanyè Биоинформатика анализ, более систематический и точный.

Одноклеточный масс - спектрометрический анализ

Batterpack Biotechnology использует систему масс - спектрометрии Fluidigm для анализа одноклеточных масс - спектрометрических потоков, используя маркеры металлических элементов (обычно специфические антитела, помеченные металлическими элементами) для маркировки молекул на поверхности и внутри клетки, затем отделяя отдельные клетки от проточных клеток, а затем анализируя спектр атомной массы отдельных клеток с помощью масс - спектрометрии плазмы с индуктивной связью (ICP - MS), zu преобразует данные спектра атомной массы в молекулярное выражение сигнала на поверхности и внутри клетки.

Преимущества сервиса:

1. Передовые технологии, заполнение технических пробелов

Использование металлических маркирующих антител позволяет избежать проблем, связанных с небольшим количеством и подверженностью взаимодействию традиционных потоковых люминесцентных каналов. Многочисленные индикаторы могут быть представлены одновременно на одноклеточном уровне, а Batterpack Biotech может обнаружить 51 целевой белок одновременно.

2. Большой объем анализа и более низкая стоимость

Одноклеточный RNAseq ограничен такими факторами, как стоимость, и общее количество анализов всех образцов клеток составляет около 2x10 ^ 4, в то время как проточная масс - спектрометрия может анализировать не менее 10 ^ 5 клеток за один раз (один образец), достигая количественного улучшения и не более дорогостоящего, чем одноклеточный RNAseq.

3. Большие перспективы применения

Результаты проточной масс - спектрометрии могут дать изменения в подгруппе клеток, в клинической диагностике, исследованиях механизмов заболевания и других аспектах имеют большие перспективы исследований;

Сочетание технологии металлической маркировки с другими технологиями будет иметь новые направления применения. В дополнение к обычным белкам, масс - спектрометрическая проточная клеточная технология также может использоваться для постпротеиновой модификации;

Может обнаруживать выживаемость клеток, размер клеток, экспрессию транскрипторов мРНК, скорость синтеза ДНК и активность протеазы.

IV. иммунополипептидный анализ на основе высокоточного масс - спектрометрии и открытие новых антигенов

Универсальные решения для иммунополипептидного анализа и обнаружения новых антигенов на основе высокоточного масс - спектрометрии BatterPack Biotech включают в себя наши собственные высокочувствительные решения по обогащению и идентификации иммунопептидов. Мы можем помочь вам идентифицировать и идентифицировать более 10 000 полипептидов типа I и более 10 000 полипептидов типа II. Благодаря нашей оптимизированной высокопроизводительной платформе иммунопептидного анализа иммунопептидный анализ может быть повторно идентифицирован и количественно определен из небольших образцовых материалов. Сервис может быть применен к крупномасштабным исследованиям, направленным на то, чтобы помочь исследователям найти решения для рака, иммунных и инфекционных заболеваний и глубоко исследовать неизвестные цели.

V. Биомедицинские признаки

На основе технологии масс - спектрометрии с высоким разрешением, MALDI TOF， Высокоэффективная хроматографическая сепарация обеспечивает широкий спектр биологических фармацевтических аналитических программ wánshán, начиная от анализа состава аминокислот и структуры первого уровня биологических продуктов, таких как dánbáizhí, полипептиды, антитела, вакцины и т. д., и заканчивая анализом изменчивости и чистоты продукта. Он предназначен для предоставления качественных услуг по анализу биомедицинских препаратов, чтобы помочь производителям биомедицинских препаратов улучшить качество биомедицинских препаратов.

Биотехнологическая платформа BatterPack

Biotechnology - Biotechnology - Biotechnology - Биопродукты, Биометрические мультикластеры

Beijing Baitai Paike Biotechnology Co., Ltd. занимается предоставлением услуг по контролю качества и проверке проектов для биологической / фармацевтической и медицинской промышленности. Лаборатории компании следуют правилам и руководящим принципам NMPA, ICH, FDA и EMA, прошли сертификацию двойной системы качества CNAS / ISO9001, создали полную систему качества, холод и тепло данных / резервное копирование в разных местах, регулярное измерение / периодическую проверку оборудования, отслеживание аудита программного обеспечения, предоставляют клиентам интегрированные решения и технические услуги, поддерживают исследования и разработки новых лекарств, регистрацию деклараций о лекарствах и выпуск продукции.

Компания использует систему контроля качества ISO9001, которая предоставляет услуги по обнаружению и анализу CRO на основе масс - спектрометрии.

2) аккредитована Национальной лабораторией CNAS для предоставления клиентам услуг по исследованию качества лекарственных средств в соответствии с глобальным законодательством в области фармацевтики;

3. Сфера деятельности охватывает такие области, как денбаизия, полипептидная, метаболическая, биомедицинская экспрессия, одноклеточный анализ, одноклеточный масс - спектрометрический поток, анализ биоинформационных облаков и мультигистологический биомасс - спектрометрический комплексный анализ;

Семь основных платформ контроля качества для удовлетворения ваших потребностей в обслуживании в режиме одного окна;

5. Обслуживание 3000 + предприятий, 10000 + выбор клиентов;

Мы стремимся предоставить вам высококачественные услуги биомасс - спектрометрии!

Можно ли использовать масс - спектрометрию для секвенирования белков?Технические услуги тестирования Подробнее