Полипептидное секвенирование с нуля - Biotechnology

Полипептидное секвенирование с нуля - BiotechnologyТехнические услуги тестирования Подробнее

Технология полипептидного секвенирования с нуля (de novo peptide sequencing) играет решающую роль в изучении группы dànbáizhí. Эта технология позволяет исследователям анализировать последовательности аминокислот полипептидов или dànbáizhí непосредственно в отсутствие эталонных последовательностей. Рождение и развитие полипептидного секвенирования с нуля значительно улучшило наше понимание разнообразия и сложности dánbáizhí, особенно в анализе неизвестных dánbáizhí, вариаций dànbáizhí или нестандартных организмов dánbáizhí.

1. Основные положения

Метод секвенирования полипептидов с нуля в основном зависит от сочетания масс - спектрометрии и вычислительных алгоритмов. В основе этой технологии лежит высокоточный качественный анализ пептидного сегмента с использованием технологии масс - спектрометрии, которая генерирует характерные ионы фрагментов пептидного сегмента с помощью таких технических средств, как высокоэнергетическая ударная диссоциация (HCD), вызываемая столкновением диссоциация (CID) и электронная метастационная диссоциация (ETD). Соотношение массы и заряда (m / z) этих ионов мусора несет информацию о структуре остатков аминокислот в пептидном сегменте. Затем вычислительные алгоритмы анализируют эти масс - спектральные данные, чтобы восстановить последовательность аминокислот в пептидном сегменте. В настоящее время широко используемые вычислительные методы включают алгоритмы соответствия спектральных карт, алгоритмы вероятностных моделей и алгоритмы нейронных сетей.

2. Технические процессы

Технический процесс секвенирования полипептидов с нуля состоит в основном из следующих этапов:

1. Подготовка проб. Обработка полипептидных образцов путем очистки, опреснения и т.п. обеспечивает высвобождение и очистку в пептидном сегменте wánquán для снижения фоновых помех и повышения чувствительности масс - спектрометрического анализа.

2. Масс - спектрометрический анализ: введение смесей пептидного сегмента в масс - спектрометр для масс - спектрометрического анализа с высоким разрешением. В настоящее время широко используемые масс - спектрометрические приборы в основном включают квадрупольный стержень - масс - спектрометрию времени полета (Q - TOF), масс - спектрометрию линейной ионной ловушки (LTQ) и масс - спектрометрию орбитальной ионной ловушки (Orbitrap). Масс - спектрометр будет генерировать большое количество масс - спектрометрических карт, каждая из которых содержит пики с различными значениями m / z, представляющие фрагментированные ионы в пептидном сегменте.

3. Анализ данных: глубокий анализ масс - спектральных данных с использованием программного обеспечения & quot; Жуанье & quot; в целях восстановления последовательностей аминокислот в пептидном сегменте. Этот процесс требует сочетания различных факторов, включая прочность ионов мусора, степень jnenenebk ngquè m / z и физико - химические свойства аминокислот.

3. Области применения

Технология секвенирования полипептидов с нуля демонстрирует свой обширный потенциал во многих областях:

В области полипептидных исследований эта технология может помочь исследователям в выявлении новых полипептидов в отсутствие эталонных последовательностей и тем самым еще больше расширить базу данных гистологии.

2. Что касается обнаружения маркеров заболевания, то методы секвенирования с нуля позволяют выявить новые полипептидные маркеры, связанные с конкретным заболеванием, и дают ключевые подсказки для ранней диагностики и лечения заболевания.

3. В области микробиологических исследований методы секвенирования с нуля могут выявить полипептидный состав Dútè для микроорганизмов в образцах нетипичных организмов или окружающей среды, что способствует глубокому пониманию экологических функций и эволюционных отношений микроорганизмов.

В процессе разработки лекарств методы секвенирования с нуля могут быть использованы для идентификации белков - мишеней, которые действуют на лекарства, оптимизации стратегий проектирования и скрининга лекарств.

Технология полипептидного секвенирования с нуля, как ключевой инструмент для изучения группы dànbáizhí, продемонстрировала свой значительный потенциал применения во многих областях.

Биотехнологический проект BatterPack

I. Секвенирование белков

BatterPaik Biotechnology использует новый масс - спектрометр Obitrap Fusion Lumos компании Thermo и систему секвенирования разложения Edman компании Isman для анализа последовательности dànbaizhí, предоставляя услуги по секвенированию белков на основе масс - спектрометрии, включая анализ состава аминокислот dànbaizhí, анализ Nduáncè xú, Cduáncè xú и полных последовательностей, а также анализ последовательностей n - enbáizhí на основе разложения Эдмана. Для dánbáizhí неизвестных теоретических последовательностей предлагается секвенирование dánbáizhí с нуля на основе метода нулевого секвенирования для анализа белковых последовательностей.

Преимущества сервиса:

Использование современного в мире масс - спектрометрического прибора Obitrap Fusion Lumos.

Обеспечивает 100 - процентное покрытие измеренной последовательности белков - мишеней;

Можно определить до 70 аминокислотных последовательностей на N - конце белка;

4. Могут быть измерены образцы в различных формах: белковые растворы, полосы белка PVDF;

5.Низкий объем использования образца: образец белка требует всего 5 - 10 мкг, чтобы завершить тестирование;

Секвенирование не зависит от модификаций n - конца, таких как закрытие n - конца, ПЭК и гликолизация.

II. ГЛОГИЧЕСКАЯ СИСТЕМА ДАНБАЙШИ

BatterPaik Biotech использует платформу Orbitrap Fusion Lumos от Thermo Fisher в сочетании с Nano - LC для предоставления количественной d à nbáizhí, целевой d à nbáizhí, полипептидной группы, транскрипционной модифицированной протеомики и других услуг по групповому анализу d à nbáizhí. Кроме того, BatterPack Biotechnology запустила новую услугу 4Ddànbáizhí на основе timsTOF Pro, которая помогает в исследованиях, таких как протеомика микрообразцов, медицина больших групп образцов и высокопроизводительная модификация.

Преимущества сервиса:

1. Высокопроизводительный количественный анализ белков: крупномасштабный экспериментальный анализ в многоконтрольной группе, в ходе которого были обнаружены новые биомаркеры;

2. Многочисленные методы маркировки d ànbáizhí in vitro и вне организма, применяемые для анализа различных образцов тканей, клеток, крови и т.д.

Высокая чувствительность масс - спектрометрического анализа и высокая повторяемость результатов экспериментов;

4. Может обнаруживать белки с низким содержанием, с широким линейным диапазоном;

5.zhuanyè Биоинформатика анализ, более систематический и точный.

Одноклеточный масс - спектрометрический анализ

Batterpack Biotechnology использует систему масс - спектрометрии Fluidigm для анализа одноклеточных масс - спектрометрических потоков, используя маркеры металлических элементов (обычно специфические антитела, помеченные металлическими элементами) для маркировки молекул на поверхности и внутри клетки, затем отделяя отдельные клетки от проточных клеток, а затем анализируя спектр атомной массы отдельных клеток с помощью масс - спектрометрии плазмы с индуктивной связью (ICP - MS), zu преобразует данные спектра атомной массы в молекулярное выражение сигнала на поверхности и внутри клетки.

Преимущества сервиса:

1. Передовые технологии, заполнение технических пробелов

Использование металлических маркирующих антител позволяет избежать проблем, связанных с небольшим количеством и подверженностью взаимодействию традиционных потоковых люминесцентных каналов. Многочисленные индикаторы могут быть представлены одновременно на одноклеточном уровне, а Batterpack Biotech может обнаружить 51 целевой белок одновременно.

2. Большой объем анализа и более низкая стоимость

Одноклеточный RNAseq ограничен такими факторами, как стоимость, и общее количество анализов всех образцов клеток составляет около 2x10 ^ 4, в то время как проточная масс - спектрометрия может анализировать не менее 10 ^ 5 клеток за один раз (один образец), достигая количественного улучшения и не более дорогостоящего, чем одноклеточный RNAseq.

3. Большие перспективы применения

Результаты проточной масс - спектрометрии могут дать изменения в подгруппе клеток, в клинической диагностике, исследованиях механизмов заболевания и других аспектах имеют большие перспективы исследований;

Сочетание технологии металлической маркировки с другими технологиями будет иметь новые направления применения. В дополнение к обычным белкам, масс - спектрометрическая проточная клеточная технология также может использоваться для постпротеиновой модификации;

Может обнаруживать выживаемость клеток, размер клеток, экспрессию транскрипторов мРНК, скорость синтеза ДНК и активность протеазы.

IV. иммунополипептидный анализ на основе высокоточного масс - спектрометрии и открытие новых антигенов

Универсальные решения для иммунополипептидного анализа и обнаружения новых антигенов на основе высокоточного масс - спектрометрии BatterPack Biotech включают в себя наши собственные высокочувствительные решения по обогащению и идентификации иммунопептидов. Мы можем помочь вам идентифицировать и идентифицировать более 10 000 полипептидов типа I и более 10 000 полипептидов типа II. Благодаря нашей оптимизированной высокопроизводительной платформе иммунопептидного анализа иммунопептидный анализ может быть повторно идентифицирован и количественно определен из небольших образцовых материалов. Сервис может быть применен к крупномасштабным исследованиям, направленным на то, чтобы помочь исследователям найти решения для рака, иммунных и инфекционных заболеваний и глубоко исследовать неизвестные цели.

V. Биомедицинские признаки

На основе технологии масс - спектрометрии с высоким разрешением, MALDI TOF， Высокоэффективная хроматографическая сепарация обеспечивает широкий спектр биологических фармацевтических аналитических программ wánshán, начиная от анализа состава аминокислот и структуры первого уровня биологических продуктов, таких как dánbáizhí, полипептиды, антитела, вакцины и т. д., и заканчивая анализом изменчивости и чистоты продукта. Он предназначен для предоставления качественных услуг по анализу биомедицинских препаратов, чтобы помочь производителям биомедицинских препаратов улучшить качество биомедицинских препаратов.

Биотехнологическая платформа BatterPack

Biotechnology - Biotechnology - Biotechnology - Биопродукты, Биометрические мультикластеры

Beijing Baitai Paike Biotechnology Co., Ltd. занимается предоставлением услуг по контролю качества и проверке проектов для биологической / фармацевтической и медицинской промышленности. Лаборатории компании следуют правилам и руководящим принципам NMPA, ICH, FDA и EMA, прошли сертификацию двойной системы качества CNAS / ISO9001, создали полную систему качества, холод и тепло данных / резервное копирование в разных местах, регулярное измерение / периодическую проверку оборудования, отслеживание аудита программного обеспечения, предоставляют клиентам интегрированные решения и технические услуги, поддерживают исследования и разработки новых лекарств, регистрацию деклараций о лекарствах и выпуск продукции.

Компания использует систему контроля качества ISO9001, которая предоставляет услуги по обнаружению и анализу CRO на основе масс - спектрометрии.

2) аккредитована Национальной лабораторией CNAS для предоставления клиентам услуг по исследованию качества лекарственных средств в соответствии с глобальным законодательством в области фармацевтики;

3. Сфера деятельности охватывает такие области, как денбаизия, полипептидная, метаболическая, биомедицинская экспрессия, одноклеточный анализ, одноклеточный масс - спектрометрический поток, анализ биоинформационных облаков и мультигистологический биомасс - спектрометрический комплексный анализ;

Семь основных платформ контроля качества для удовлетворения ваших потребностей в обслуживании в режиме одного окна;

5. Обслуживание 3000 + предприятий, 10000 + выбор клиентов;

Мы стремимся предоставить вам высококачественные услуги биомасс - спектрометрии!

Полипептидное секвенирование с нуля - BiotechnologyТехнические услуги тестирования Подробнее