Стандарты доставки услуг по индивидуальному тестированию кольцевых РНК - чипов

Сервис индивидуального обнаружения кольцевых РНК - чипов

Техническое описание эксперимента: Циклическая РНК(ircRNA) - это новый класс РНК, отличающийся от традиционной линейной РНК, с замкнутой кольцевой структурой, которая присутствует в больших количествах в группе транскрипции истинных ядер. Большая часть кольцевой РНК состоит из экзосомных последовательностей, которые консервативны в различных видах и имеют экспрессивные особенности тканей и различных стадий развития. из-заЦиклическая РНКНечувствителен к нуклеотидным ферментам и поэтому более стабилен, чем линейная РНК, что дает кольцевой РНК явное преимущество в разработке и применении в качестве нового диагностического маркера. Недавние исследования показали, что кольцевая РНК играет роль губки miRNA в различных видах, называемых конкурирующими эндогенными РНК (ceRNA), которые могут конкурировать с miRNA. Взаимодействие с ассоциированными с болезнью микроРНК показывает, что кольцевая РНК играет очень важную роль в регулировании заболевания.

Экспериментальный рабочий процесс:

1. Экстракция образцов РНК

2) Контроль качества РНК

Нанодроп используется для измерения поглощения РНК в спектрофотометрах 260 нм, 280 нм и 230 нм для расчета концентрации и оценки чистоты.

2) электрофорез дегенеративного агаридного геля с формальдегидным электрофорезом для проверки чистоты и целостности РНК.

Предоставление отчета RNA QC.

Обработка Rnase R

Синтез и маркировка образцов cDNA / aRNA

Контроль качества эффективности маркировки использует Nanodrop для проверки эффективности флуоресцентной маркировки, а эффективность маркировки соответствует требованиям для обеспечения надежности результатов последующих экспериментов с чипом.

6 Гибридизация чипов

В стандартных условиях помеченные зонды и геномные чипы высокой плотности скрещиваются.

Сбор изображений и анализ данных

Сканирование интенсивности флуоресценции чипа с помощью лунного сканера с сердечником GenePix 4000B и преобразование результатов эксперимента в цифровое хранение данных с использованием программного обеспечения для анализа исходных данных.

8 Предоставление отчетов об экспериментах

Scanning Image: Cy3 флуоресцентное сканирование изображений;

Scatter Plot: Диаграмма рассеяния, X - значение сигнала Control, Y - значение сигнала Experiment, отражающее общую тенденцию распределения сигнальных данных;

Raw Data: Исходные данные об интенсивности сканирующего флуоресцентного сигнала зонда;

Normalized Data: значения после стандартизации статистическими методами;

P - value: T - test статистический анализ генов, экспрессируемых с существенными различиями, чем меньше p - value, тем более заметной является дифференциальная экспрессия circРНК между двумя группами образцов

⑥ significant Up & Down Regulated CircRNA List: Список circRNA с существенными различиями в экспрессии содержит подробные примечания к Fold Change, p - valuel и circRNA (соответствующие точки соединения линейной мРНК и миРНК).

Клиенты предлагают:

Объектом эксперимента является образец ткани, взятый в соответствующем количестве (50 - 100 мг) образец свежей ткани или правильно сохраненный образец ткани, используемый

BioPulverizer TM замораживает измельченную ткань, плюс 1 м РНК - экстракционный реагент TRIzol (Invitrogen), который извлекает РНК после симметрии mini - Bead - Beater - 16.

Объектом эксперимента были образцы клеток, каждая из которых брала клетки 1x106 - 1x107, плюс 1 - метровый РНК - экстракционный реагент TRIzol (образец для клеток, прикрепленных к стенке, с использованием 1 мл на 10 см2 чашки Петри TRIzo1), и РНК была извлечена после крекинга.

Критерии доставки:

1 Данные тестирования чипов

Полные протоколы экспериментальных операций, отчеты об экспериментах (включая результаты анализа программного обеспечения) и экспериментальные материалы

Экспериментальные услуги: